相対式ホーム2面2線を持つ地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡してあります。佐世保線には特急みどりや特急ハウステンボスなどが走っていますが、高橋には停まりません・・・。下りホームの裏手には田園風景が広がります。1989年(平成元年)に建築された駅舎は、オランダ風をイメージしてあります。無人駅ですが、自動券売機(磁気式)が設置されています。